平衡穩(wěn)定的微生態(tài)環(huán)境對(duì)防止動(dòng)物疾病很重要。幾種病原菌生長的適宜 pH 值都中性偏堿，如大腸桿菌適宜 pH 值為 6.0-8.0，鏈球菌為 6.0-7.5，葡萄球菌為 6.8-7.5，梭狀芽孢桿菌為 6.0-7.5，而乳酸桿菌等適宜于酸性環(huán)境生殖。因此，酸化劑通過降低胃腸道pH 值可抑制有害微生物繁殖，減少營養(yǎng)物的消耗和細(xì)菌毒素的產(chǎn)生，同時(shí)促進(jìn)有益菌的增殖。除了降低腸道 pH 值外，有機(jī)酸還有另一種殺滅病原菌的作用機(jī)理。有機(jī)酸進(jìn)入動(dòng)物胃腸道內(nèi)后有一部分解離產(chǎn)生氫離子，從而降低 pH 值，而另外一部分則不解離而是以分子形式存在。只有這部分以分子形式存在的有機(jī)酸能通過細(xì)菌的細(xì)胞膜而進(jìn)入到細(xì)菌內(nèi)部。在細(xì)菌細(xì)胞內(nèi) pH 值為中性，所以有機(jī)酸分子會(huì)在此解離產(chǎn)生氫陽離子和羧根負(fù)離子。氫陽離子會(huì)降低細(xì)菌細(xì)胞內(nèi) pH 值，而細(xì)菌要維持正常的生命就必須將細(xì)胞內(nèi) pH 值保持在 7.0 左右，因此細(xì)菌細(xì)胞要通過 H+-ATP 泵將氫陽離子排到細(xì)胞外，這個(gè)過程消耗大量的能量（ATP），從而使得細(xì)菌失去活力。另一方面，羧根負(fù)離子可以抑制細(xì)菌細(xì)胞核內(nèi)的 DNA 和蛋白質(zhì)的合成過程使得細(xì)菌不能繁殖下一代(Stratford& Anslow,1998；Russel&Diez-Gonzales,1998；Roeetal.,1998)。因此酸化劑的直接殺菌效果取決于酸的解離程度，解離程度越低的酸殺菌效果越強(qiáng)，解離程度越高的酸直接殺菌效果越差。一般來說，無機(jī)酸（如磷酸）的解離程度很高，因此其直接的殺菌作用差；有機(jī)酸解離程度低，殺菌效果則相對(duì)較強(qiáng)。而有機(jī)酸當(dāng)中不同的有機(jī)酸的殺菌作用也存在差異，其中檸檬酸、乳酸因解離程度比其它有機(jī)酸高而殺菌效果較差，甲酸、乙酸、丙酸的殺菌效果較好。因此甲酸、乙酸、丙酸是比較理想的具有殺菌作用的有機(jī)酸。另外酸化劑的作用還取決于酸的濃度和分子數(shù)，濃度越高，分子數(shù)越多，其作用效果越好，因此大分子有機(jī)酸的殺菌效果比較差。

此外，研究表明，由小分子有機(jī)酸組成的復(fù)合有機(jī)酸具有比單項(xiàng)小分子有機(jī)酸更強(qiáng)的抑菌作用。R?ssler（1997）測(cè)試了甲酸、乙酸、丙酸、延胡索酸、檸檬酸和乳酸的對(duì)大腸桿菌的最低抑菌濃度，發(fā)現(xiàn)甲酸的有效抑菌濃度最低，即抑菌效果最好，其次是丙酸、乙酸和延胡索酸，而乳酸和檸檬酸抑菌效果最差。他們還發(fā)現(xiàn)，甲酸與丙酸的復(fù)合物抑菌能力是甲酸或丙酸單酸的 2-4 倍。